Hlavné smery liečby myokarditídy sú určené hlavnými článkami patogenézy myokarditídy: zápalom vyvolaným infekciou, nedostatočnou imunitnou odpoveďou, smrťou kardiomyocytov (v dôsledku nekrózy a progresívnej dystrofie, myokarditickej kardiosklerózy) a poruchou metabolizmu kardiomyocytov. Treba vziať do úvahy, že u detí sa myokarditída často vyskytuje na pozadí chronickej fokálnej infekcie, ktorá sa stáva nepriaznivým pozadím (intoxikácia a senzibilizácia tela) a prispieva k rozvoju a progresii myokarditídy.