Pri primárnej tuberkulóze je lézia zvyčajne lokalizovaná v lymfatických uzlinách, pľúcach, pohrudnici a niekedy aj v iných orgánoch: obličkách, kĺboch, kostiach, pobrušnici. Oblasť špecifického zápalu môže byť veľmi malá a počas vyšetrenia zostať skrytá. Ak je lézia rozsiahla, zvyčajne sa zistí počas klinického a rádiologického vyšetrenia pacienta.