H. influenzae sú gramnegatívne pleomorfné tyčinkovité alebo kokoidné bunky s rozmermi (0,2-0,3) x (0,5-2) µm. V náteroch sa nachádzajú jednotlivo alebo v pároch, niekedy vo forme krátkych reťazcov a skupín. Na hustých médiách tvoria malé (s priemerom do 1 mm) okrúhle bezfarebné kolónie. Mikroorganizmy sú nehybné, netvoria spóry, ale je možná tvorba kapsulárnych foriem, s ktorými sú spojené patogénne vlastnosti. Patogén produkuje endotoxín, ktorého nosičom sú kapsulárne polysacharidy.