Chronická hepatitída B s delta agensom je vo väčšine prípadov závažnejšia ako hepatitída B nekomplikovaná delta vírusom. Existujú dôkazy o tom, že vírusové faktory (genotyp) môžu do značnej miery určovať priebeh ochorenia. Vo všeobecnosti, na rozdiel od chronickej hepatitídy B a vírusovej hepatitídy C, pri ktorých najmenej 70 – 50 % pacientov prežije svoj život bez vzniku cirhózy pečene, 100 % pacientov s chronickou vírusovou hepatitídou D nevyhnutne vyvinie cirhózu pečene v priebehu 15 – 30 rokov od okamihu infekcie bez liečby.