Medzi malígnymi nádormi sú najčastejšie hepatoblastóm a hepatocelulárny karcinóm. Je známych niekoľko vrodených anomálií, ktoré zvyšujú riziko nádorov pečene: hemihypertrofia, vrodená agenéza obličiek alebo nadobličiek, Wiedemannov-Beckwithov syndróm (organomegália, omfalokéla, makroglosia, hemihypertrofia), Meckelov divertikul. Nasledujúce ochorenia tiež zvyšujú riziko nádorov pečene.