Pacientov znepokojujú nasledujúce príznaky kliešťovej encefalitídy: bolesť hlavy, celková slabosť, malátnosť, zimnica, pocit tepla, potenie, závraty, bolesť očných buliev a svetloplachosť, strata chuti do jedla, bolesť svalov, kostí, chrbtice, horných a dolných končatín, dolnej časti chrbta, krku a kĺbov.