Meningokoky sú gramnegatívne guľovité bunky s priemerom 0,6-0,8 µm. V náteroch pripravených z materiálu odobratého od pacienta majú tvar kávového zrna, často sa nachádzajú v pároch alebo tetrádach, alebo náhodne, často vo vnútri leukocytov - neúplná fagocytóza.