Štúdium (analýza) mozgovomiechového moku má dôležitú diagnostickú hodnotu pri ochoreniach centrálneho nervového systému a mozgových blán, ako je encefalitída (zápal mozgu), meningitída (zápal mozgových blán), arachnoiditída (zápal arachnoidálnej membrány), syfilis mozgu, cievne mozgové príhody, nádory a poranenia.