Štúdia: gény ovplyvňujú protirakovinovú účinnosť ovocia a vlákniny

Nedávna štúdia publikovaná v časopise eBioMedicine identifikovala genetické variácie, ktoré môžu ovplyvniť súvislosť medzi príjmom vlákniny, ovocia a zeleniny a rizikom kolorektálneho karcinómu (CRC). Výskumníci úspešne identifikovali dva významné lokusy, ktoré ovplyvňujú súvislosť medzi príjmom vlákniny a ovocia a rizikom CRC.

Koronárny karcinóm (KOK) je jedným z najbežnejších druhov rakoviny na svete s takmer dvoma miliónmi nových prípadov a viac ako 900 000 úmrtiami v roku 2020. Vysoký príjem ovocia, zeleniny, celozrnných výrobkov a vlákniny údajne znižuje riziko KKO. Hoci existujú silné dôkazy o súvislosti medzi rizikom KKO a príjmom celozrnných výrobkov a vlákniny, dôkazy o súvislosti medzi rizikom KKO a príjmom ovocia a zeleniny zostávajú obmedzené.

Predchádzajúce celogenómové asociačné štúdie (GWAS) identifikovali najmenej 200 lokusov spojených s rizikom kolorektálneho karcinómu, čo vysvetľuje až 35 % dedičnosti. Hoci interakcie gén-prostredie (G × E) môžu vysvetliť ďalšiu dedičnosť, predchádzajúce štúdie s malými vzorkami a tradičnými metódami zistili len obmedzený počet významných interakcií. Nové štatistické prístupy, ako sú konjointné testy a dvojkrokové metódy, ktoré uprednostňujú jednonukleotidové polymorfizmy (SNP), majú potenciál zlepšiť presnosť týchto analýz.

Do analýzy bolo zahrnutých až 45 štúdií z troch genetických konzorcií CRC, ktoré zahŕňali jednotlivcov európskeho pôvodu. Štúdie zahŕňali súbory prípad-kontrola pre kohortové štúdie a kontrolné súbory bez rakoviny pre prípad-kontrolné štúdie. Celkovo bolo analyzovaných 69 599, 69 734 a 44 890 účastníkov z hľadiska príjmu ovocia, zeleniny a vlákniny. Príjem potravy bol hodnotený pomocou dotazníkov o frekvencii jedál a stravovacích anamnéz, zvyčajne vyjadrených v porciách za deň pre ovocie a zeleninu a gramoch za deň pre celkovú vlákninu.

Dáta boli harmonizované a vyjadrené ako kvartilové hodnoty podľa pohlavia a štúdie. Okrem toho kontrola kvality genotypizácie zahŕňala kontrolu chýbajúcich údajov, Hardyho-Weinbergovej rovnováhy a nesúladu pohlaví, po čom nasledovala imputácia a filtrovanie frekvencie a presnosti minoritných alel, čo viedlo k analýze 7 250 911 SNP.

V porovnaní s kontrolnou skupinou boli účastníci s kolorektálnym karcinómom starší, mali vyšší index telesnej hmotnosti a príjem energie a vyššiu prevalenciu rizikových faktorov, ako je rodinná anamnéza kolorektálneho karcinómu a cukrovky 2. typu. V porovnaní s kontrolnou skupinou tiež konzumovali menej vlákniny, ovocia a zeleniny. Metaanalýzy zistili inverznú súvislosť medzi príjmom vlákniny (relatívne riziko na kvartilový nárast (OR) = 0,79), ovocia (OR = 0,79) a zeleniny (OR = 0,82) a rizikom kolorektálneho karcinómu.

3-DF test identifikoval lokus rs4730274 pred génom SLC26A3, čo ukazuje súvislosť s príjmom vlákniny a interakciu s rizikom kolorektálneho karcinómu (CRC). Stratifikácia podľa genotypu ukázala silnejšiu inverznú súvislosť medzi vlákninou a CRC pre každú kópiu alely T. Funkčná anotácia naznačila aktivitu zosilňovača v tkanivách hrubého čreva s eQTL pre gén DLD.

Lokus rs1620977 v blízkosti génu NEGR1 vykazoval významnú súvislosť s konzumáciou ovocia a miernu interakciu s rizikom kolorektálneho karcinómu. Silné inverzné asociácie boli pozorované so zvyšujúcou sa konzumáciou ovocia pre každú kópiu alely G.

Táto štúdia je doteraz najväčšou štúdiou G×E, v ktorej výskumníci identifikovali dve interakcie medzi vlákninou, príjmom ovocia a rizikom kolorektálneho karcinómu (CRC). Konkrétne, rs4730274 v blízkosti génu SLC26A3 naznačuje významnú súvislosť medzi príjmom vlákniny, funkciou čriev, zápalom a CRC. Výsledky si vyžadujú ďalšie štúdie na preskúmanie klinických dôsledkov a potvrdenie týchto zistení v rôznych populáciách.